BAKTERIE

Dodatkowe
oznaczenia

Acinetobacter calcoaceticus

A

Actinobacillus actinomycetemcomitans

Actinomadura madurae

Actinomadura pelletieri

Actinomyces gerencseriae

Actinomyces israeli

Actinomyces pyogenes

Actinomyces spp.

Aeromonas hydrophila

Alcaligenes faecalis

A

Arcanobacterium haemolyticum (Corynebacterium haenolyticum)

Arthrobacter globiformis

A

Bacillus subtilis (Laseczka sienna)

A

Bacillus thuringiensis

A

Bacteroides fragilis

Bartonella bacillifonnis

Bartonella quintana (Rochalimaea quintana) (Riketsja gorączki okopowej)

Bartonella (Rochalinea) spp.

Bordetella bronchiseptica (Pałeczka oskrzelowa)

Bordetella parapertussis (Pałeczka rzekomokrztuścowa)

Bordetella pertussis (Pałeczka krztuśca)

V

Borrelia burgdorferi (Krętek boreliozy z Lyme)

Borrelia duttonii

Borrelia recurrentis (Kretek duru powrotnego)

Brevibacterium linens

A

Campylobacter fetus (Mątwik płodowy)

Campylobacter jejuni

Campylobacter spp.

Cardiobacterium hominis

Chlamydia pneumoniae

Chlamydia trachomatis

Chlamydia psittaci

Clostridium botulinum (Laseczka jadu kiełbasianego)

T

Clostridium perfringens (Laseczka zgorzeli gazowej)

Clostridium tetani (Laseczka tężca)

T, V

Clostridium spp.

Corynebacterium diphtheriae (Maczugowiec błonicy)

T, V

Corynebacterium minutissimum

Corynebacterium pseudotuberculosis (Maczugowiec rzekomogruźliczy)

Corynebacterium spp.

Cytophaga allerginae

A, T

Edwardsiella tarda

Ehrlichia sennetsu (Rickettsia sennetsu)

Ehrlichia spp.

Eikenella corrodens

Enterobacter aerogenes/cloacae

Enterobacter spp.

Enterococcus spp.

Erysipelothrix rhusiopathiae (Włoskowiec różycy)

Escherichia coli (z wyjątkiem szczepów niepatogennych) (Pałeczka okrężnicy)

Flavobacterium meningosepticum

Fluoribacter bozemanae (Legionella bozemaniae)

Francisella tularensis (Typ B) (Pałeczka tularemii, typ. B)

Fusobacterium necrophorum

Gardnerella vaginalis (Pałeczka pochwowa)

Haemophilus ducreyi (Pałeczka wrzodu miękkiego)

Haemophilus influenzae (Pałeczka grypy)

Haemophilus spp.

Helicobacter pylori

Klebsiella oxytoca

Klebsiella pneumoniae (Pałeczka zapalenia płuc)

Klebsiella rhinoscleromatis

Klebsiella spp.

Legionella pneumophila (Pałeczka legionellozy)

Legionella spp.

Leptospira interrogans (wszystkie typy serologiczne)

Listeria monocytogenes (Pałeczka listeriozy)

Listeria ivanovii

Morganella morganii

Mycobacterium avium/intracellulare (Prątek gruźlicy ptasiej)

Mycobacterium chelonae

Mycobacterium fortuitum (Prątek przypadkowy)

Mycobacterium kansasii

Mycobacterium malmoense

Mycobacterium marinum

Mycobacterium paratuberculosis

Mycobacterium scrofulaceum

Mycobacterium simiae

Mycobacterium szulgai

Mycobacterium xenopi

Mycoplasma caviae

Mycoplasma hominis (Mikoplazma ludzka)

Mycoplasma pneumoniae (Mikoplazma zapalenia płuc)

Neisseria flavescens

Neisseria gonorrhoeae (Dwoinka rzeżączki, gonokok)

Neisseria meningitidis (Dwoinka nagminnego zapalenia opon mózgowo-rdzeniowych, meningokok)

V

Nocardia asteroides

Nocardia brasiliensis

Nocardia farcinica

Nocardia nova

Nocardia otitidiscaviarum

Pantoea agglomerans (Erwinia herbicola, Enterobacter agglomerans)

A, T

Pasteurella multocida (Pałeczka posocznicy krwotocznej)

Pasteurella spp

Peptostreptococcus anaerobius

Plesiomonas shigelloides

Porphyromonas spp.

Prevotella spp.

Proteus mirabilis (Odmieniec dziwaczny)

Proteus penneri

Proteus vulgaris (Odmieniec pospolity)

Providencia alcalifaciens

Providencia rettgeri

Providencia spp.

Pseudomonas aeruginosa (Pałeczka ropy błękitnej)

Rhodococcus equi                        

Rickettsia spp.

Saccharomonospora viridis

A

Saccharopolyspora rectivirgula

A

Salmonella arizonae

Salmonella enteritidis

Salmonella typhimurium (Pałeczka duru mysiego)

Salmonella paratyphi A, B, C (Pałeczka duru rzekomego)

V

Salmonella (inne typy serologiczne, z wyłączeniem S.typhi)

Serpulina spp.

Shigella boydii

Shigella dysenteriae, inne niż Typ 1 (Pałeczka czerwonki)

Shigella flexneri

Shigella sonnei

Staphylococcus aureus (Gronkowiec złocisty)

Streptobacillus moniliformis

Streptococcus pneumoniae (Dwoinka zapalenia płuc, pneumokok)

Streptococcus pyogenes (Paciorkowiec ropotwórczy)

Streptococcus suis

Streptococcus spp.(Paciorkowce)

Streptomyces albus

A

Streptomyces spp.

A

Thermoactinomyces thalpophilus

A

Thermoactinomyces vulgaris

A

Treponema caratem (Krętek pinty)

Treponema pallidum (Krętek blady, krętek kiły)

Treponema pertenue (Krętek framboezji, krętek malinicy)

Treponema spp.

Vibrio cholerae (włącznie z El Tor) (Przecinkowiec cholery)

Vibrio parahaemolyticus

Vibrio spp.

Yersinia enterocolitica (Pałeczka jersiniozy)

Yersinia pseudotuberculosis (Pałeczka rodencjozy)

Yersinia spp.

Adenoviridae

Astroviridae

Bunyaviridae

Bunyavirus:

Wirus Buynamwera

Wirus Bhanja

Wirus Germiston

Wirus kalifornijskiego zapalenia mózgu

Hantavirus:

Wirus Prospect Hill

Nairovirus:

Wirus Hazara

Phlebovirus:

Wirus sandfly fever

Wirus Toscana

Caliciviridae

Norovirus 2

Inne wirusy z Caliciviridae

Coronaviridae

Coronavirus (z wyjątkiem wirusa SARS)

Herpesviridae

Wirus opryszczki pospolitej typu 1 i 2 (HSV-1 i 2)

Wirus ospy wietrznej i półpaśca (VZV)

Wirus cytomegalii (CMV)

Ludzki herpes wirus typu 6 (HHV 6)

Ludzki herpes wirus typu 7 (HIV-7)

Wirus Epsteina-Barr (EBV)

Ludzki herpes wirus typu 8 (HIV-8)

D

Orthomyxoviridae

Wirusy grypy typu A, B i C

Wirusy Dhori I Thogoto (arbowirusy)

V (c)

Papovaviridae

Wirusy BK i JC

D (d)

Papillomaviridae

Ludzkie wirusy papilloma

D (d)

Paramyxoviridae

Wirus odry

Wirus świnki (nagminnego zapalenia przyusznic)

Wirus rzekomego pomoru drobiu (choroba Newcastle)

Wirusy Parainfluency typu 1-4

Wirus RS (Respiratory syncytial virus)

V

V

Parvoviridae

Ludzki parwowirus (B 19)

Picornaviridae

Enterovirus:

Wirus ostrego krwotocznego zapalenia spojówek AHC

(ludzki enterowirus typu 70)

Wirusy Coxsackie 2

Wirusy Echo 2

Wirus zapalenia wątroby typu A (ludzki enterowi rus typu 72)

Wirusy polio szczepy atenuowane

V

V

Rhinovirus

Poxviridae

Orthopoxvirus:

Wirus ospy bawołów (e)

Wirus ospy krów

Wirus ospy wielbłądów

Wirus krowianki (wirus vaccinia)

Wirus ospy słoni (f)

Wirus ospy królików (g)

Parapoxvirus:

Wirus Orf

Wirus guzków dojarek

Molluscipoxvirus:

Wirus mięczaka zakaźnego

Yatapoxvirus:

Wirus yaba

Wirus tanapox

Reoviridae:

Coltivirus

Rotavirus

Orbivirus

Reovirus

Rhabdoviridae

Wirus pęcherzykowatego zapalenia jamy ustnej (VSV),

szczepy laboratoryjne

Togaviridae

 Alfavirus

Wirus bebaru

Wirus o'nyong-nyong

Wirus Ross River

Wirus Sindbis

Rubivirus

Wirus różyczki

V

Toroviridae

Acanthamoeba castellani

Ancylostoma duodenale (Tęgoryjec dwunastnicy)

Angiostrongylus cantonensis

Angiostrongylus costaricensis

Ascaris lumbricoides (Glista ludzka)

A

Ascaris suum (Glista świńska)

A

Babesia divergens

Babesia microti

Balantidiwn coli (Szparkosz okrężnicy)

Brugia malayi

Brugia pahangi

Brugia timori

Capillaria philippinensis

Capillaria spp.

Clonorchis sinensis (Przywra wątrobowa, chińska)

Clonorchis viverrini

Cryptosporidium parvum

Cryptosporidium spp.

Cyclospora cayetanensis

Dipetalonema streptocerca

Diphyllobothrium latum (Bruzdogłowiec szeroki)

Dracunculus medinensis (Robak medyjski, riszta)

Entamoeba histolytica (Pełzak czerwonki)

Fasciola gigantica (Przywra olbrzymia)

Fasciola hepatica (Motylica wątrobowa)

Fasciolopsis buski (Przywra jelitowa)

Giardia lamblia (Giardia intestinalis) (Wielkowściec jelitowy, Lamblia)

Hymenolepis di minuta (Tasiemiec szczurzy)

Hymenolepis Nana (Tasiemiec karłowaty)

Leishmania ethiopica

Leishmania mexicana

Leishmania peruviana

Leishmania tropica

Leishmania major

Leishmania spp.

Loa loa

Mansonella ozzardi

Mansonella perstans

Necator americanus

Onchocerca volvulus

Opisthorchis felineus (Przywra kocia)

Opisthorchis spp.

Paragonimus westermani

Plasmodium spp. (ludzki i małpi) (Zarodziec)

Sarcocystis suihominis

Schistosoma haematobium (Przywra krwi, przywra żylna)

Schistosoma intercalatum

Schistosoma japonicum (Przywra żylna japońska)

Schistosoma mansoni (Przywra żylna Mansona)

Schistosoma mekongi

Strongyloides stercoralis (Węgorek jelitowy)

Strongyloides spp.

Taenia saginata (Tasiemiec nieuzbrojony)

Toxocara canis (Glista psia)

Toxoplasma gonidii (Toxoplazma)

Trichinella spirali (Włosień kręty, Włosień spiralny)

Trichuris trichiura (Włosogłówka ludzka)

Trypanosoma brucei brucei (Świdrowiec śpiączki)

Trypanosoma brucei gambiense (Świdrowiec gambijski)

Wuchereria bancrofti (Nitkowiec ludzki)

Aspergillus fumigatus (Kropidlak popielaty)

A

Candida albicans (Bielnik biały)

A

Candida tropicalis (Bielnik tropikalny)

Cryptococcus neoformans var. neofonnans (Filobasidiella neofonnans var. neofonnans)

A

Cryptococcus neoformans var. gattii (Filobasidiella bacillispora)

A

Emmonsia parva var. parva

Emmonsia parva var. crescens

Epidermophyton floccosum

A

Fonsecaea compacta

Fonsecaea pedrosoi

Madurella grisea

Madurella mycetomatis

Microsporum spp.

A

Neotestudina rosatii

Penicillium marneffei

A

Scedosporium apiospermum (Pseudallescheria boydii)

Scedosporium prolificans (inflatum)

Sporothrix schenckii

Trichophyton rubrum (Grzyb czerwony)

Trichophyton spp.